Futan Dominium -pelissä, jossa Futanari on todellisia, yhteiskunta murtuu syvälle juurtuneiden ennakkoluulojen ja väärinkäsitysten avulla. Sisään Luna, mielenkiintoinen 18-vuotias, joka muuttaa uuteen kaupunkiin äitipuoli-paikansa kanssa, joka on tunnettu Futanarin hyväksymisestä. Kun Luna sopeutuu uuteen kouluunsa ja alkaa ystävystyä, hänen saapuminen tapahtuu samanaikaisesti poliittisen myrskyn kanssa.
Toisella puolella on demokraatit, jotka ovat linjassa konservatiivisten joukkojen kanssa, jotka aikovat ylläpitää status quoa, katsomalla Futanaria epävakauttavan vaikutuksena. Toisaalta on republikaanien puolue, joka on perinteinen, mutta nyt Futanari -kannattajien ohjaaja, joka puolustaa kiihkeästi laajennettuja oikeuksia ja tunnustusta. Jännitteiden noustessa kysymys on edelleen: Kuka tulee voittajaksi tässä lisääntyvässä poliittisessa taistelussa?